Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GGCXP38435 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGCXP38435 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms