Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBRP36941 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms