Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5C1P36542 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms