Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RYKP34925 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RYKP34925 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RYKP34925 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms