Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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OTX2P32243 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OTX2P32243 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OTX2P32243 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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