Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms