Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms