Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms