Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPREP23469 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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