Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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