Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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