Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME1P15531 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms