Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFLP07196 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFLP07196 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms