Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYBBP04839 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms