Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFB1P01137 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms