Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1AO95602 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms