Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN9O95484 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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