Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms