Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3AO14802 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms