Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms