Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN25C9JDP6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN25C9JDP6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN25C9JDP6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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