Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms