Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDR42E2A6NKP2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms