Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms