Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAPRE3Q9UPY8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms