Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms