Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms