Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms