Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms