Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms