Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN3Q9P232 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms