Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms