Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZCCHC17Q9NP64 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms