Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms