Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLMPQ9H6B4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms