Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR88Q9GZN0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms