Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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