Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms