Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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C9orf16Q9BUW7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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