Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms