Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms