Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCF12Q99081 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms