Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms