Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms