Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EP400Q96L91 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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