Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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RNF185Q96GF1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RNF185Q96GF1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RNF185Q96GF1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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RNF185Q96GF1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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