Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC11Q96DB2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms