Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKD1Q969G9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms