Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-CQ95604 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms