Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms